Исследователи ищут противораковые антигены в пропущенных участках протеома
Строгие правила поиска генов исключали короткие и неканонические рамки считывания, поэтому возможные белки не попадали в каталоги.
Опухоли транслируют последовательности, которых нет в здоровых тканях; их фрагменты могут предъявляться через HLA и распознаваться T-клетками.
Epitopea готовит mRNA-вакцину CryptiVax-1001 с общими для рака яичников темными антигенами.
Главная нерешенная задача — отличить функциональные белки от случайной транскрипции, ошибок процессинга и продуктов деградации.
Почему важно
Пропущенные белки могут расширить набор мишеней для терапии, но вычислительное предсказание придется подтверждать экспериментально.